数字化产品

JN Medsys数字PCR

阅读 84  ·  发布日期 2018-05-07

详细信息

数字PCR是可以实现分子绝对定量的仪器,和PCR技术、荧光定量PCR(qPCR)技术相比,具有绝对定量优势,和高通量测序(NGS)相比,又具有较高的灵活性,兼具成本把控优势。JN Medsys的数字PCR(Clarity TM)是一种新型的数字PCR,可实现分子的绝对定量。不同于微滴式数字PCR,该仪器采用了8联管管内芯片设计,分区更稳定,无需移液步骤,数据更准确。每个上样管内部的高密度芯片拥有10000个分区,拥有高灵敏。具有独特优势:8联管兼容市面上的普通PCR仪和试剂,降低实验成本;采用了封闭式系统,减小了污染;全自动分区,利用表面张力、虹吸原理上样,分区速度小于1分钟;分析速度在同类仪器中突出,96个反应时间仅为4小时。十分适合低丰度分子的高灵敏度、绝对定量分析。




8联管管内芯片设计专利技术





检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的绝对定量,从而提供了比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究,尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况,比如等位基因的不平衡表达以及单细胞基因表达分析等;

2. 其他基因组学及表观遗传学相关研究

①拷贝数变异(CNV)研究:

通过8连管内芯片上上万个分区对样本进行处理及后续扩增,摆脱Ct值的计算方法而直接获取目标基因的绝对拷贝数,为拷贝数变异的研究提供了绝对的检测精度。还可进行NGS文库定量,成本低、通量高。


②稀有突变检测:

对于稀有突变检测,定量PCR、及NGS等方法都因受到背景DNA的干扰,使得检测灵敏度及精确性都达不到精细定量的要求(如定量PCR检测中Ct值大于33的情况下,其重复性就不是很高), 而JNMedsys ClarityTM Digital PCR通过对样本的上万个分区处理,使得稀有突变从大量的背景DNA中分离出来,从而提高了检测的灵敏度及重复性。


3. 医学分子检测

①精准医疗(转化医学)的应用:

如肺癌等相关的EGFR、KARS、BRAF基因的SNP突变检测、乳腺癌的HER2基因检测等从而指导各种靶向药物的选择与用药方案的调整。


②疾病超早期分子检测:

随着研究的展开,很多实验室发现基于ddPCR对于诸如血液、痰液、尿液等体液样品中核酸水平的疾病相关标记分子(DNA、mtDNA、miRNA等)的检测,其发现疾病的时间远早于影像学或其他蛋白类标记物的相关检测,而且结果的灵敏度更高,稳定性更好,与传统的核酸检测方法相比,大大提前了疾病发现的窗口期,更好地实现对疾病的早发现,早治疗。


4 病原微生物的检测(病毒、细菌等)

疾病预防控制中心、出入境检验检疫局系统的实验室目前主要采用基于TaqMan探针法的定量PCR体系对病原微生物进行核酸水平的检测,而这些目前正在使用着的检测体系可以无缝地转移到JNMedsys ClarityTM Digital PCR上,从而满足该类实验室对于检测结果的要求:灵敏度更高、重复性更好、无需依赖标准曲线的绝对定量结果,同时操作简便。


5 转基因食品或成分的检测

目前在确定转基因作物或成分的含量时采取定量PCR的标准曲线法,这种方法需要依赖于已知浓度的标准品(Certified Reference Materials Calibrants, CRMCs)。JNMedsys ClarityTM Digital PCR绝对定量的方式可以彻底解决这些标准物质的定标工作。



配置参数:

Clarity™ Auto Loader

 (自动上样仪)

自动上样仪(Clarity™ Auto Loader)
PCR反应液上样到8联管内的高密度微孔芯片中,能将反应液自动分成1万个纳升级的等分区域。PCR反应液体积仅需15ul
*
分区稳定,各区间无融合或相互干扰。
*可同时上样8个样品,分区时间少于1分钟,96个样本少于10分钟
*上样后的操作均在8联管内进行,无液体转移步骤,可降低样品损失,避免交叉污染
电源条件:
100~240V

1 set

Clarity™ Sealing Enhancer

(封闭优化仪)

封闭优化仪(Clarity™ Sealing Enhancer)
利用气压平衡原理,自动将微孔道分区内PCR反应液位置居中,然后加入封闭液,将样本封闭在芯片分区中。
仪器可直接开机使用,无需预热,无需封闭程序调节
封闭液
封闭后的
8联管可直接进行PCR扩增反应。

1 set

Clarity™ Reader

(数据读取仪)

数据读取仪(Clarity™ Reader)
PCR
扩增后产物通过数据读取仪进行结果检测
*每次可上样32个样本
采用
CMOS读取PCR反应后芯片微孔分区内的荧光信号
LED作为检测光源
*信号读取快速,45分钟内可完成96个样品的数据读取。
具有双重荧光检测通道,支持双重基因检测。可检测
FAM & VIC/HEX荧光探针,也可兼容EvaGreenSYBR Green染料。
完全封闭的检测模式,可有效避免交叉污染。

1 set

分析软件

可通过计算机连接并控制数据读取仪,进行荧光信号影像采集。
通过荧光影像数字化分析结果,软件利用
泊松分布演算法计算样本靶目标的分子拷贝数与样本原始浓度。
可对多个样品的平均值和总误差进行统计分析。
软件对双探针分析的结果可以给出散点图。
结果可直接打印,或以
Excel表格形式输出。

1 set

Clarity Consumables Package (96 reactions)

(耗材)

Clarity consumbales packages, 96 reactions.
includes: 
1.Clarity sealing fluid, 30ml 
  Clarity 
分区封闭液,30毫升
2. Clarity Tube-strip, set of 12 
  Clarity 
芯片式8连管,12
3. Calrity sample laodingkit, set of 12
    Clarity 
上样套装,12

1 set

JN Solution, 96 reaction

1 set